Khủng Bố Ở Tokyo: Bối cảnh phim là một phiên bản khác của thành phố Tokyo, nơi bị tàn phá bởi một cuộc tấn công gây chấn động của bọn khủng bố. Đầu mối duy nhất về danh tính của bọn thủ phạm chính là một video lạ được tải lên mạng. Không chỉ phải đau đầu vì đầu mối này, cảnh sát cũng đang bất lực trong việc ngăn chặn chứng Paranoia (chứng hoang tưởng) đang lan rộng xuyên khắp Nhật Bản.
Trong lúc cả thế giới đang truy tìm thủ phạm để đổ lỗi cho thảm kịch này, hai thiếu niên bí ẩn dưới cái bí danh Nine (ナイン) tức số 9- tên thật Kokonoe Shin (九重新) và Twelve (ツエルブ) tức số 12- tên thật Hisami Fuyuji (久見冬二), cả hai gộp lại thành Nhân Sư (スピンクス), toan tính một kế hoạch tàn ác để thức tỉnh thế giới với ngón tay đặt sẵn trên cò súng.